事業(yè)單位對基本建設投資的會計處理和報告在適用本制度的同時，還應當按照國家有關規(guī)定單獨建賬、單獨核算。

根據(jù)財政部規(guī)定適用行業(yè)會計制度的事業(yè)單位，執(zhí)行相應行業(yè)會計制度，不執(zhí)行本制度;實行企業(yè)化管理的事業(yè)單位，執(zhí)行企業(yè)會計準則體系，不執(zhí)行本制度。

二、事業(yè)單位應當按照下列規(guī)定運用會計科目：

(一)事業(yè)單位應當按照本制度的規(guī)定設置和使用會計科目。

在不影響會計處理和編報財務報表的前提下，可以根據(jù)實際情況自行增設、減少或合并某些會計科目，以及自行設置本制度規(guī)定之外的明細科目。

(二)本制度統(tǒng)一規(guī)定會計科目的編號，以便于填制會計憑證、登記賬簿、查閱賬目，實行會計電算化管理。事業(yè)單位不得隨意打亂重編。

(三)事業(yè)單位在填制會計憑證、登記會計賬簿時，應當填列會計科目的名稱，或者同時填列會計科目的名稱和編號，不得只填列科目編號、不填列科目名稱。

三、事業(yè)單位財務報告是事業(yè)單位對外提供的反映事業(yè)單位某一特定日期的財務狀況和某一會計期間的運營成果、預算執(zhí)行等會計信息的文件。事業(yè)單位應當按照下列規(guī)定編報財務報告：

(一)事業(yè)單位財務報告由會計報表、會計報表附注和財務情況說明書組成。會計報表和會計報表附注構成財務報表。會計報表包括資產負債表、收入支出表、財政撥款收入支出表以及有關附表。

(二)事業(yè)單位的財務報告分為年度財務報告和中期財務報告。

以短于一個完整的會計年度的期間(如季度和月度)編制的財務報告稱為中期財務報告。年度財務報告是以整個會計年度為基礎編制的財務報告。

(三)事業(yè)單位對外提供的財務報表的內容和格式，由本制度規(guī)定。事業(yè)單位內部管理需要的財務報表由事業(yè)單位自行規(guī)定。

(四)事業(yè)單位應當根據(jù)本制度有關財務報表的編制基礎、編制依據(jù)、編制原則和方法的要求，對外提供真實、完整的財務報表。

事業(yè)單位不得違反規(guī)定，隨意改變財務報表的編制基礎、編制依據(jù)、編制原則和方法，不得隨意改變本制度規(guī)定的財務報表有關數(shù)據(jù)的會計口徑。

(五)事業(yè)單位財務報表應當根據(jù)登記完整、核對無誤的賬簿記錄和其他有關資料編制，要做到數(shù)字真實、計算準確、內容完整、報送及時。

(六)事業(yè)單位對外提供的財務報告應當由單位負責人和主管會計工作的負責人、會計機構負責人(會計主管人員)簽名并蓋章;設置總會計師的單位，還應當由總會計師簽名并蓋章。

事業(yè)單位年度財務報告應當按照有關規(guī)定經過注冊會計師審計。

四、事業(yè)單位會計機構設置、會計人員配備、會計基礎工作、會計檔案管理以及內部控制等，按照《中華人民共和國會計法》、《會計基礎工作規(guī)范》、《會計檔案管理辦法》等規(guī)定執(zhí)行。