雙方可以協(xié)商處理。《土地承包法》第38條規(guī)定：“土地承包經(jīng)營權(quán)采取互換、轉(zhuǎn)讓方式流轉(zhuǎn)，當(dāng)事人要求登記的，應(yīng)當(dāng)向縣級以上地方人民政府申請登記。未經(jīng)登記，不得對抗善意第三人?！痹摋l款明確了土地承包經(jīng)營權(quán)的公式對抗主義，登記對抗善意第三人。也就是說，雙方對互換土地原享有的承包權(quán)利和承擔(dān)的義務(wù)相應(yīng)互換，當(dāng)事人可以要求辦理農(nóng)村土地承包經(jīng)營權(quán)證變更登記手續(xù)。不登記，不影響土地承包經(jīng)營權(quán)的變更。但是在遇到征地后，沒有到村委會辦理變更手續(xù)的話，補償款由原承包戶獲得。當(dāng)然，如果辦理了變更手續(xù)，補償款就由變更后的權(quán)利人享有。所以，為了完整的享受土地權(quán)利，互換土地承包經(jīng)營權(quán)的農(nóng)民們，一定要去村委會申請辦理變更登記手續(xù)，以避免不必要的糾紛和損失。【法律依據(jù)】《土地承包法》帶三十八條，土地承包經(jīng)營權(quán)采取互換、轉(zhuǎn)讓方式流轉(zhuǎn)，當(dāng)事人要求登記的，應(yīng)當(dāng)向縣級以上地方人民政府申請登記。未經(jīng)登記，不得對抗善意第三人。