《行政處罰法》第44條規(guī)定，“行政處罰決定依法作出后，當事人應(yīng)當在行政處罰決定的期限內(nèi)，予以履行?！备鶕?jù)這一規(guī)定，政府部門發(fā)現(xiàn)違法建筑在建時，應(yīng)依據(jù)《城鄉(xiāng)規(guī)劃法》等法律法規(guī)的規(guī)定作出責(zé)令停止建設(shè)的行政處罰。如果違建人在行政處罰決定的期限內(nèi)不予履行，在履行公告、告知復(fù)議或訴訟、催告等法定程序后，就可以依法拆除。

《行政強制法》第四十四條規(guī)定：“對違法的建筑物、構(gòu)筑物、設(shè)施等需要強制拆除的，應(yīng)當由行政機關(guān)予以公告，限期當事人自行拆除。當事人在法定期限內(nèi)不申請行政復(fù)議或者提起行政訴訟，又不拆除的，行政機關(guān)可以依法強制拆除?！备鶕?jù)這一規(guī)定，當事人申請行政復(fù)議或者提起行政訴訟期間，行政機關(guān)是不可以強制拆除的。然而違法建筑若出現(xiàn)在征地拆遷中，綜合違法建筑的認定考量因素和處理原則，可以作如下處理：

1、 第一種情況不屬于違法建筑的范疇，屬于因歷史原因合法建造的房屋，可依《物權(quán)法》第30條取得物權(quán)，應(yīng)當完全納入拆遷征收補償范圍。

2、 第二種情況屬于在當事人無違法主觀認識下客觀上形成的存量違法建筑，如果自具體認定和處理時間節(jié)點往前計算在處罰時效內(nèi)，按第《行政處罰法》第44條處理；如果在處罰時效之外，就應(yīng)按照《行政處罰法》第29條而不予追究，基于已經(jīng)穩(wěn)定的社會關(guān)系，應(yīng)當完全納入拆遷征收補償范圍。        

3、 第三種情況造成的存量違法建筑，當事人與政府均有過錯。由于政府在行政管理關(guān)系中的地位處于強勢地位，其過錯程度也應(yīng)高一些。在對該等存量違法建筑進行處理時，應(yīng)當納入拆遷征收補償范圍予以適當補償，比例可以考慮在標準賠償額的70%以上。        

4、 第四種情況是在政府默許的狀態(tài)下造成的違法建筑。對于政府應(yīng)積極履責(zé)之行政行為，2年內(nèi)采取以罰代拆、以罰代管等措施或者不作為也應(yīng)推定為政府默許，其原因在于：①過錯責(zé)任原則；②一事不再罰原則；對于這個情形造成的違法建筑，如果在處罰時效內(nèi)，當事人應(yīng)承擔(dān)政府默許的舉證責(zé)任，自然應(yīng)當完全納入拆遷征收補償范圍;如果在處罰時效之外，即為超過追究時效的存量違法建筑，理應(yīng)按照第一種情況完全納入拆遷征收補償范圍。       

 5、 第五種情況系通過受讓取得他人的違法建筑。對于該種情形的違法建筑具體認定和處理期間應(yīng)從時間節(jié)點溯及至違法建筑的原占有人的“建成”之時。如果該違法建筑在處罰時效之內(nèi)，應(yīng)給予現(xiàn)違法建筑占有人以受讓對價補償，以填平補償當事人的直接損失，使當事人遭受的損失降至最低;如果在處罰時效之外，也應(yīng)按照第一種情況完全納入拆遷征收補償范圍。        

6、第六種情況為棚戶區(qū)。應(yīng)本著實事求是的原則，采取適當補償為宜。       

 7、第七種情況系政府征收時違法吊銷當事人證照造成事實上的違法建筑。當事人可以根據(jù)《行政訴訟法》第45條等規(guī)定要求補償 及賠償。