(一)從保護受害人的利益出發(fā)，在確定訴訟時效的起算時間時，應當盡可能地不適用“應當知道”的標準進行推定，而更多地適用“知道”的標糊行認定。

(二)起算時間要考慮專業(yè)因素。許多損害發(fā)生的原因，難以為普通患者所能了解，有些藥品的毒副作用所造成的損害，要經過數年時間才能清楚，因此，應當考慮除專業(yè)人員以外，其他人不易了解損害發(fā)生的原因。在這種情況下，訴訟時效的起算就有其特殊性。

(三)起算時間的確定要考慮傷害的明顯程度。根據最高人民法院《民法通則意見》第168條的規(guī)定，人身損害賠償的訴訟時效期間，傷害明顯的，從受害之日起算;傷害當時未曾發(fā)現的，后經檢查確診并能證明是由侵害引起的，從傷勢確診之日起算。對最高人民法院的這一規(guī)定，可以從下幾個方面進行具體的操作：

1、醫(yī)療損害行為侵害身體權的，行為一經實施，當事人就知道或者應當知道權利被侵害，訴訟時效期間可以開始起算。

2、醫(yī)療損害行為侵害生命權的，從受害人死亡之日起計算訴訟時效期間。

3、醫(yī)療損害行為侵害健康權的，傷害明顯的，從傷害之日起計算訴訟時效期間;傷害在侵害之時不能發(fā)生的，經檢查確診傷害的，從確診之日起算訴訟時效期間;傷害造成勞動能力喪失的，在確診勞動能力喪失的程度時起算訴訟時效期間。

(四)合理考慮時效中斷的事由。在司法實踐中，患者就自己的病情向加害方進行咨詢、向有關部門寫信要求解決、向醫(yī)療事故鑒定委員會申請鑒定等，均可以認定為訴訟時效的中斷事由。另外，雖然患者知道了權利被侵害的事實，但是如果患者因受到侵害而住院治療，提起訴訟或者主張有困難的，也可以有考慮訴訟時效的中止。

(五)將訴訟時效完成的舉證責任分配給加害一方當事人。加害人是醫(yī)療機構，具有專業(yè)知識，其對患者傷情發(fā)生等情況在舉證能力上強于患者，患者一般難以確切得知，所以為了保護受害人，應當將證明訴訟時效已經屆滿的舉證責任分配給加害人。